50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2248 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  48.96 
 
 
209 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  42.64 
 
 
199 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  39.8 
 
 
206 aa  171  9e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  41.79 
 
 
210 aa  168  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  36.55 
 
 
206 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  43.68 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  38.2 
 
 
373 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  37.27 
 
 
279 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  33.07 
 
 
373 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  37.21 
 
 
258 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  31.34 
 
 
371 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  40.7 
 
 
423 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  36.26 
 
 
367 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  32.94 
 
 
267 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  40.23 
 
 
259 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  38.82 
 
 
367 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  35.9 
 
 
359 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  33.71 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  39.29 
 
 
371 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  25.44 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  29.73 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  31.69 
 
 
253 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  24.85 
 
 
256 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  40.23 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  29.92 
 
 
364 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  39.74 
 
 
370 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  39.08 
 
 
256 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  25.44 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  39.74 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  32.81 
 
 
366 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  30.86 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  30.86 
 
 
256 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  34.44 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  36.26 
 
 
365 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.87 
 
 
368 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  41.25 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  41.25 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  37.66 
 
 
372 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  35.9 
 
 
287 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  29.35 
 
 
367 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 
371 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  38.75 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  35.9 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  37.18 
 
 
369 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  35.29 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>