47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1802 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  744    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  49.6 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  43.42 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  34.04 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  40 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  33.78 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  35.86 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  36.29 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  34.1 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  31.34 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  35.74 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.98 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  31.95 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  35.09 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  35.13 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  36.25 
 
 		 423 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  31.52 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  29.82 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  35.96 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  31.72 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  36.46 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  30.49 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  29.22 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  29.39 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  36.59 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  36.29 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  35.42 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  34.95 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  34.76 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  34.31 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  36.73 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  34.91 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  30.61 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  34.69 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  35 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  34 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  31.07 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2174  3-methylpurine-DNA glycosylase  25 
 
 		 147 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  37.66 
 
 		 210 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  28.12 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>