47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3107 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  96.46 
 
 		 254 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  76.19 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  47.83 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  46.06 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  42.91 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  45.04 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  42.97 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  37.75 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  42.69 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  43.61 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  37.6 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  43.24 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  38.25 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  44.53 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  39.69 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  37.85 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  41.58 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  26.09 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  27.13 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.48 
 
 		 365 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  36.27 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  30.14 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  31.54 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  30.14 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  32.23 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  30.07 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  35.29 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  32.99 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  34.07 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  35.58 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  34.68 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  26.9 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  37.63 
 
 		 371 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  34.19 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  31.03 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  28.18 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  33.64 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  38.04 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  27.89 
 
 		 373 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  33.06 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  37.36 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  41.25 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  35.05 
 
 		 373 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  27.59 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  29.31 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  34.41 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>