99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1387 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
54 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  83.33 
 
 
54 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1249  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  81.48 
 
 
54 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.789093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1376  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.63 
 
 
54 aa  87.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1308  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.08 
 
 
57 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0719045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  49.06 
 
 
58 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1307  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.94 
 
 
57 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0430  hypothetical protein  49.09 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.06 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.604017  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0507  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.17 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1124  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.17 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.794697  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  43.48 
 
 
592 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  45.1 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.67 
 
 
428 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.08 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1946  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.17 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  41.82 
 
 
410 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  41.82 
 
 
410 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  41.82 
 
 
410 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.25 
 
 
310 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.62 
 
 
283 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  32.08 
 
 
280 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.65 
 
 
368 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.9 
 
 
368 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 
278 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 
351 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
367 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  41.18 
 
 
368 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  40 
 
 
398 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.54 
 
 
282 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.55 
 
 
545 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
840 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  37.78 
 
 
375 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  37.78 
 
 
293 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  45.65 
 
 
305 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  35.29 
 
 
273 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  40.43 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
283 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
383 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  41.67 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.18 
 
 
378 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.22 
 
 
392 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40 
 
 
399 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  42 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 
57 aa  42  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.74 
 
 
592 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0774678  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.68 
 
 
287 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  47.62 
 
 
634 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1082  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.46 
 
 
606 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
980 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  40.43 
 
 
301 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
980 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 
418 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.62 
 
 
604 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 
376 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.56 
 
 
296 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.74 
 
 
285 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.29 
 
 
791 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0165  hypothetical protein  41.3 
 
 
227 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.16 
 
 
986 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 
367 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0346  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  41.51 
 
 
352 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.715364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4260  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
531 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
713 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
285 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
947 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.943439  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 
620 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.82 
 
 
290 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  38 
 
 
396 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.38 
 
 
593 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  34 
 
 
271 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.55 
 
 
369 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34 
 
 
371 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 
553 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
719 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  33.96 
 
 
274 aa  40  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 
707 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
936 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000976966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.29 
 
 
389 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0651793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  36.17 
 
 
367 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  38 
 
 
498 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
719 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.900758  normal  0.200774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.16 
 
 
987 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0995  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
366 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
277 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 
553 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>