117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0521 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
54 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1249  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.15 
 
 
54 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.789093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1376  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  87.04 
 
 
54 aa  93.6  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  83.33 
 
 
54 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1308  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  71.15 
 
 
57 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0719045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  50.94 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0430  hypothetical protein  47.27 
 
 
59 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0507  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.94 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1307  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.27 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.17 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.604017  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1946  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.94 
 
 
58 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1124  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.28 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.794697  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  43.14 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.18 
 
 
310 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  43.9 
 
 
592 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.18 
 
 
545 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.9 
 
 
368 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.44 
 
 
428 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 
351 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.22 
 
 
791 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  42 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.54 
 
 
282 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  45.83 
 
 
305 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
283 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.74 
 
 
283 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  38.18 
 
 
410 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  35.29 
 
 
273 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  50 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
367 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.51 
 
 
604 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  38.18 
 
 
410 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 
368 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4260  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
531 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  35.85 
 
 
280 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
368 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  35.56 
 
 
293 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.31 
 
 
593 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0075  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5499  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 
679 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948929  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
840 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.83 
 
 
394 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  37.78 
 
 
398 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  31.37 
 
 
324 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.68 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  34.62 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.78 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
316 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0261  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.25 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
713 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
987 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  43.75 
 
 
395 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
553 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
553 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  35.85 
 
 
274 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
984 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
984 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 
131 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45384  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
980 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 
392 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
287 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 
293 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  45.28 
 
 
379 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
383 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
373 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  37.25 
 
 
368 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  38 
 
 
558 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  34 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  36.51 
 
 
436 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
443 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
285 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 
553 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  38.3 
 
 
375 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  41.67 
 
 
507 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  38.3 
 
 
425 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.295211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.83 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  41.67 
 
 
507 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  44 
 
 
274 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.58 
 
 
278 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38 
 
 
399 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.17 
 
 
283 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
316 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
418 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.54 
 
 
590 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
719 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  36.36 
 
 
422 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  38.18 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
553 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.13 
 
 
299 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>