158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1155 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1155  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 377 aa  754    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0763  hypothetical protein  74.19 
 
 		 371 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.560466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  25.15 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.48 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 		 233 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  22.49 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  26.32 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  23.84 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  27.59 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.78 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  22.62 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 217 aa  57  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 242 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  26.9 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.63 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  25.3 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 217 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  23.67 
 
 		 226 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  26.04 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  30.77 
 
 		 237 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  27.45 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  27.54 
 
 		 238 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  22.02 
 
 		 232 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1667  hypothetical protein  27.72 
 
 		 525 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291552  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 		 226 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  22.5 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  34 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  25.56 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.73 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  30.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  25.13 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  26.21 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  23.49 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  29.91 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  27.66 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  32.69 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  26.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  24.64 
 
 		 220 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2346  phosphate uptake regulator, PhoU  25.86 
 
 		 224 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1788  phosphate uptake regulator, PhoU  20.69 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135594  normal  0.0168871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  25.24 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  25.49 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  23.91 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  25 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  20.42 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0561  phosphate uptake regulator, PhoU  23.64 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0233  hypothetical protein  21.83 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  27.62 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  29.81 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  21.82 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  26.67 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  28.16 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  26.67 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  27.88 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  27.43 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  27.88 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  27.83 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  28.16 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0956  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  28.18 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.63 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  27.88 
 
 		 242 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.63 
 
 		 218 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>