60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1384 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  48.39 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  46.91 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  43.24 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  43.3 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  40.74 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  46.97 
 
 
63 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  46.97 
 
 
63 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  45.71 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  43.94 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  40.3 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  40.74 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  43.75 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  37.97 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  37.97 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  40.26 
 
 
99 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  38.36 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  41.89 
 
 
109 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  45.16 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  43.33 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  41.33 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  37.23 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  40.3 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  42.42 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  34.43 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  35.14 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  33.85 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  38.27 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  38.27 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  33.85 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  41.43 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2110  Protein of unknown function DUF2078, membrane  40 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0166472  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  39.74 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  35.21 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  34.29 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  34.52 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  35.53 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  33.82 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  39.42 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1752  hypothetical protein  46 
 
 
87 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00351059  normal  0.0988412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>