38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3696 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  79.57 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  82.8 
 
 
93 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  83.87 
 
 
93 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  83.87 
 
 
93 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  87.1 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  78.49 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  47.3 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  46.05 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  46.05 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.84 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  37.37 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  34.15 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  41.89 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  37.21 
 
 
121 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  30.93 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  42.53 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  35.44 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  30.34 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.8 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  39.13 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  42.03 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  42.03 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.43 
 
 
85 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3081  hypothetical protein  44.19 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  33.71 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  37.08 
 
 
85 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  33.78 
 
 
98 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>