36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3671 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  98.81 
 
 
84 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  98.81 
 
 
84 aa  168  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  66.25 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  66.25 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  65.82 
 
 
80 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  44.33 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  52.94 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  36.89 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  51.47 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  51.47 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  51.47 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  45.59 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  39.76 
 
 
82 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  39.29 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  44.12 
 
 
93 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  43.9 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  39.13 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  39.13 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  42.65 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  38.64 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  41.18 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  40.24 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  39.06 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  37.66 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  37.18 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  40.51 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  42.19 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  42.19 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  57.58 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  28.92 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>