47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2159 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  46.91 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  46.99 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  38.57 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  45.31 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  50.67 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  43.68 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  43.24 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  44.16 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  43.21 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  44.58 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  35.44 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  32.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  43.94 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  43.94 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.25 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  34.58 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  37.63 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  36 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2580  Protein of unknown function DUF2078, membrane  32.31 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  37.66 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  37.66 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  37.66 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  37.97 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  39.24 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  54.84 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2760  tetratricopeptide TPR_2  77.27 
 
 		 566 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  43.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  35.94 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  37.88 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  41.07 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  43.08 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  32.14 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1904  hypothetical protein  36.21 
 
 		 77 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238415  hitchhiker  0.00126081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>