36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5372 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  88.17 
 
 
93 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  88.17 
 
 
93 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  79.57 
 
 
88 aa  146  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  82.8 
 
 
93 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  89.25 
 
 
93 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  56.94 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  56.94 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  56.94 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  44.74 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  44.74 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  40.91 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  40.91 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  40.91 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  36.71 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  32.99 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  43.68 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  37.21 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  40.22 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.19 
 
 
80 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  36 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  35.96 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  30.68 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  38.89 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  34.18 
 
 
82 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  28.09 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.82 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  45.16 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.47 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>