36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1486 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  66.25 
 
 
84 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  66.25 
 
 
84 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  66.25 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  62.03 
 
 
80 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  43.43 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  43.21 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  46.38 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  41.33 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  44.93 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  44.93 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  44.93 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  40.48 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  39.44 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  44.93 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  44.93 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  43.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  40.51 
 
 
109 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  33.82 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  35.16 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  38.71 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  39.44 
 
 
106 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  38.1 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  28.95 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  41.27 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>