35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2871 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  133  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  78.49 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  77.42 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  77.42 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  80.65 
 
 
93 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  77.42 
 
 
93 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  48.61 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  39.53 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  41.33 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  41.33 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  32.35 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  36.96 
 
 
133 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.76 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  35.14 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  41.18 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  31.82 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  34.25 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  31.08 
 
 
82 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  27.03 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  29.41 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  35.23 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>