46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0602 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  84.71 
 
 
85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  41.56 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  43.94 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  38.27 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  46.88 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  32.88 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  41.54 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2228  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  41.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  32.43 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  39.24 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0248  hypothetical protein  34.15 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.602604  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  43.33 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  43.33 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  43.33 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0683  hypothetical protein  34.57 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0162075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  41.79 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  35.9 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  38.03 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  51.92 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0767  hypothetical protein  43.86 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1724  hypothetical protein  37.29 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  29.87 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  65.52 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  32.05 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  31.08 
 
 
88 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  40.54 
 
 
96 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  38.1 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0741  Protein of unknown function DUF2078, membrane  54.29 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000877498  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  38.1 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.68 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  62.07 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  28.57 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1136  hypothetical protein  51.61 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.516592  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  34.92 
 
 
89 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  35.94 
 
 
63 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  35.94 
 
 
63 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>