36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3234 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  95.7 
 
 
93 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  88.17 
 
 
93 aa  146  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  77.42 
 
 
88 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  82.8 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  76.34 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  76.34 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  58.33 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  58.33 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  58.33 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  47.3 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  40.24 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  37.37 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.84 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  40.4 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  40.7 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  43.42 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  43.42 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  34.83 
 
 
82 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  46.03 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  37.84 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  30.11 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  38.16 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  43.48 
 
 
84 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  37.36 
 
 
80 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  37.8 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  44.74 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  31.82 
 
 
122 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>