45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0507 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  63.89 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  54.12 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  56.47 
 
 
93 aa  87  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  55.29 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  55.29 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  58.33 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  56.94 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  58.33 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  57.33 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  42.99 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  44.57 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  47.5 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  43.04 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.49 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  46.25 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  42.68 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  42.68 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  41.25 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  42.68 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  39.51 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  49.33 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  40 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  35.62 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  37.33 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  40.26 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  44.74 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  41.54 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  41.54 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  37.35 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  36.62 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  34.94 
 
 
109 aa  43.5  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  45.16 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  39.24 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  40.3 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  27.91 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  35.94 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>