28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3442 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  64.1 
 
 
80 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  42.27 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  43.9 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  42.35 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  43.21 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  38.04 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  37.25 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  40.48 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  43.66 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  43.66 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  40.48 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  43.66 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  36.49 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  37.08 
 
 
93 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  44.78 
 
 
93 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  42.19 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  32.43 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  36.9 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  35.06 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  37.97 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0101  hypothetical protein  69.23 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>