24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2926 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  198  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  36.46 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  40.26 
 
 
106 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  40.51 
 
 
96 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  44.58 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.24 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  38.54 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  41.46 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  41.18 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  41.46 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  33.68 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  36.9 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  38.03 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  43.08 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  32.53 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>