25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1653 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  28.89 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  41.46 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  39.47 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  43.66 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  38.24 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.03 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  34.26 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  37.04 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  36.25 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0765  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  36.76 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  36.76 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  41.1 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  36.76 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0248  hypothetical protein  28.75 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.602604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  31.76 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  37.33 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  37.93 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  37.88 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  29.58 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  44 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>