31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2227 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  221  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  42.34 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  43.14 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  48.39 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  36.89 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  36.89 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  36.89 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2178  hypothetical protein  42.5 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548601  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  40.45 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  37.25 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  38.24 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  32.35 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  32.69 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  36.46 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  32.69 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  42.22 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  37.23 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  35.05 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  34.58 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  37.23 
 
 		 80 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  32.26 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  30.34 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  30.34 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  31.37 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>