57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2741 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  51.56 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  52.5 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  48.72 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  37.88 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  45.31 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  43.48 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  42.65 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  41.25 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  41.25 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  42.65 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  48.94 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  68.57 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  46.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  38.67 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  62.5 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  41.77 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  46.3 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35.9 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  40.98 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  37.5 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  39.06 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  40.3 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  38.71 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  32.89 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  38.71 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2525  hypothetical protein  39.47 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.186034 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  36.67 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  36.67 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  36.67 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  35.82 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  32.79 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  41.07 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  38.1 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  38.1 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  38.16 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  37.31 
 
 		 148 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  33.73 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1904  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238415  hitchhiker  0.00126081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  58.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2978  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  39.06 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  39.47 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  36.9 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1949  hypothetical protein  31.34 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>