29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4050 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  46.97 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  45.16 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  39.06 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  42.19 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  41.54 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  41.54 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  41.54 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  42.19 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  42.19 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  42.03 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4521  hypothetical protein  45.16 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.663863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  42.19 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  42.19 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1177  hypothetical protein  53.19 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.473321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  34.85 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  33.82 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  46.38 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  44.26 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  37.74 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  35.82 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  35.94 
 
 		 82 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>