30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1579 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  69.86 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  69.86 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  39.73 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  36.67 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  37.93 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1904  hypothetical protein  42.11 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238415  hitchhiker  0.00126081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  33.82 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  33.82 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  35.94 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  32.89 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  41.43 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  35.21 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  37.1 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  34.52 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  30.95 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  35.53 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  41.51 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  33.96 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  35.82 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  35.82 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  35.63 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  34.21 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  28.36 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  38.3 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>