42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1904 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238415  hitchhiker  0.00126081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  42.67 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  50.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  50.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  36.11 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  42.5 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  38.16 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  35 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  36.26 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  43.37 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  26.83 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  31.82 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  31.82 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  30.77 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4521  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  43.9  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.663863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  35.48 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  31.34 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1724  hypothetical protein  40.98 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2580  Protein of unknown function DUF2078, membrane  31.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  31.58 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  39.34 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  31.03 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  27.38 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  27.38 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  39.68 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  30.43 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  30.68 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>