48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0211 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  41.94 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.77 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  36.49 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  35 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.91 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  37.84 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  44.26 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  35.62 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  40.3 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  41.79 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  45.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  37.66 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  39.76 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2978  hypothetical protein  37.93 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  35.44 
 
 		 75 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  35.82 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  35.82 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  35.82 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  39.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  32.47 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  32.22 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  36.25 
 
 		 99 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2110  Protein of unknown function DUF2078, membrane  51.28 
 
 		 82 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0166472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>