39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0297 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  85.37 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  39.74 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  39.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  45.31 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  40.24 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  46.55 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  41.56 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  37.68 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  44.64 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  41.43 
 
 
85 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  44.44 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  52.31 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0248  hypothetical protein  33.87 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.602604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  40.96 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  51.06 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  39.13 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  39.13 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  51.35 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  46.27 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  60 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2978  hypothetical protein  41.38 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  43.48 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  35.29 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1109  hypothetical protein  34.25 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0251692  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  51.35 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  51.35 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0767  hypothetical protein  36.11 
 
 
74 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  39.39 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  31.58 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  33.77 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  34.48 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  38.96 
 
 
96 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  36.23 
 
 
121 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>