33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_823 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  80.95 
 
 		 80 aa  137  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  89.29 
 
 		 84 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  41.56 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  48.19 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  40.51 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  49.15 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  36.78 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  32.05 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  40.62 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  34.12 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  34.18 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  31.03 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  52.27 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  52.27 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  31.58 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1949  hypothetical protein  32.89 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  35.44 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  35.82 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  35.82 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  35.21 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  35.21 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  43.08 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  63.33 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 87 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  35.38 
 
 		 81 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  33.87 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>