35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0952 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  79.76 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  80.95 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  43.24 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  47.06 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  38.57 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  50.85 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35.62 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  38.57 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  41.94 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.47 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  39.06 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  39.06 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  39.06 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  34.94 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  32.94 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  45.9 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  34.18 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  52.78 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  32.89 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  32.89 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  41.43 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  29.49 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  38.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  44.07 
 
 		 82 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  29.07 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2228  hypothetical protein  33.93 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1110  hypothetical protein  79.17 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00257696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>