19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1333 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  258  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  89.68 
 
 
148 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  53.19 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  47.83 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  34.58 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  32.74 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  31.51 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  32.76 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  36.36 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  35.8 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  38.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  36.08 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  33.65 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0906  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000104891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  55.17 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  40.54 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  35.16 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>