30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1380 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  153  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1177  hypothetical protein  51.47 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.473321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4521  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.663863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  39.39 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  38.71 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  42.65 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  42.65 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  37.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  35.38 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  31.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  40.35 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  25.93 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1904  hypothetical protein  35 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238415  hitchhiker  0.00126081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  38.67 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  38.03 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  33.82 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  30.67 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2228  hypothetical protein  30.51 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>