23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2228 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2228  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  44.78 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  34.72 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  42.65 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  41.89 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  34.67 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  32.89 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  38.55 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  40.54 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  40.35 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  35.44 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0767  hypothetical protein  42.37 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0683  hypothetical protein  41.54 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0162075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  40.32 
 
 
73 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4521  hypothetical protein  36.62 
 
 
70 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.663863  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1724  hypothetical protein  38.24 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0741  Protein of unknown function DUF2078, membrane  50 
 
 
148 aa  40.8  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000877498  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  32 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  29.23 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  29.23 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  30.59 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>