54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1280 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  55.21 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  52.44 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  48.39 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  43.48 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  47.89 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  47.89 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  47.89 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  43.68 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  39.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  40 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  43.08 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  31.46 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  41.54 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  39.39 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  37.76 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  42.25 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  38.2 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  42.03 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  38.2 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  38.82 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  39.39 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  34.43 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  29.49 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  39.39 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  58.06 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  29.49 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  33.8 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  37.08 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3081  hypothetical protein  62.5 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  53.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  35.96 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  53.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  30.56 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  55.17 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  41.27 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  41.27 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7398  hypothetical protein  41.27 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  32.98 
 
 		 137 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>