45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0836 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  79.76 
 
 		 80 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  89.29 
 
 		 84 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  46.99 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  55.17 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  36.71 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  33.77 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  35.37 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  38.33 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  29.49 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  33.72 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  29.17 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  29.49 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0906  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000104891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  35.38 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  35.82 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  35.82 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  52.63 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  51.35 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  31.43 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  31.43 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  30 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  30 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  30 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2110  Protein of unknown function DUF2078, membrane  30 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0166472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1949  hypothetical protein  32.47 
 
 		 74 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  33.87 
 
 		 89 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  33.87 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1110  hypothetical protein  79.17 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00257696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  28.77 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  27.91 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2228  hypothetical protein  35.09 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>