21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0192 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  36.71 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  37.65 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  32.91 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  37.04 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  34.18 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  55.56 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  36.92 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  39.73 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0902  hypothetical protein  27.91 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  38.16 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  27.4 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0906  hypothetical protein  53.12 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000104891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1804  hypothetical protein  51.72 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  34.92 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  36.99 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>