23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0036 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  173  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  41.77 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  45.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  38.57 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.73 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  41.11 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  40.98 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  35.82 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  39.71 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  34.92 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  41.67 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0713  hypothetical protein  35.53 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000015115  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0137  Protein of unknown function DUF2078, membrane  52.5 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  45 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0297  hypothetical protein  55.56 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  32.26 
 
 
85 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  37.14 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0741  Protein of unknown function DUF2078, membrane  34.38 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000877498  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1110  hypothetical protein  62.07 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00257696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>