17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1110 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1110  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00257696  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  41.25 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  40.51 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  31.87 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  35.53 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  38.24 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  36.76 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0192  hypothetical protein  27.94 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.345827  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  36.76 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  30.88 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  31.65 
 
 
121 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  39.24 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  42.37 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  35.53 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  48.72 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>