13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2525 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2525  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  269  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.186034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1682  hypothetical protein  38.06 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.915767  normal  0.549175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2719  hypothetical protein  33.09 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1189  hypothetical protein  37.82 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00189357  hitchhiker  0.000000932746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1269  hypothetical protein  30.17 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1303  hypothetical protein  31.53 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0302906  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2648  Protein of unknown function DUF2078, membrane  44.29 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2992  Protein of unknown function DUF2078, membrane  31.75 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.887884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  39.47 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  25.88 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0875  Protein of unknown function DUF2078, membrane  54.35 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2330  hypothetical protein  30.21 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.374624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  62.16 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>