10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1189 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1189  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00189357  hitchhiker  0.000000932746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2719  hypothetical protein  47.73 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1682  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.915767  normal  0.549175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0875  Protein of unknown function DUF2078, membrane  35 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2525  hypothetical protein  37.82 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.186034 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3324  hypothetical protein  31.37 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2992  Protein of unknown function DUF2078, membrane  30.58 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.887884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2648  Protein of unknown function DUF2078, membrane  34.12 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1619  hypothetical protein  52.27 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1303  hypothetical protein  42.65 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0302906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>