39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4484 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4484  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  41.58 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  43.21 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  42.31 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.38 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  46.38 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  46.38 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  46.38 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  41.89 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  36.96 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  38.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  40.74 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  46.27 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  39.06 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  37.18 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  41.79 
 
 
85 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  36.67 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  35.06 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  39.24 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  37.33 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  40.74 
 
 
121 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  30.59 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  37.5 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1653  hypothetical protein  38.37 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00825715  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  34.67 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  34.67 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  34.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>