30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5332 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  77.42 
 
 
88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  83.87 
 
 
93 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  76.34 
 
 
93 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  75.27 
 
 
93 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  79.57 
 
 
93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  54.17 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  54.17 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  54.17 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  47.3 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  41.41 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  38.37 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  33.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  39.33 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  39.33 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  39.33 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  32.08 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  39.19 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  38.04 
 
 
85 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  32 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  34.09 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  43.04 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  33.8 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  34.78 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  33.78 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>