18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0101 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0101  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  221  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  51.35 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  40.66 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  38.24 
 
 
114 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  42.03 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  61.29 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  34.57 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  55.26 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  43.48 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  41.3 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  39.44 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  39.44 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  39.44 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  57.58 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  44.23 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3636  hypothetical protein  38.24 
 
 
94 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>