117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2656 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2656  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  100 
 
 		 438 aa  913    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  36.82 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3228  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.52 
 
 		 448 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.992169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2279  hypothetical protein  34.09 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.26 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0220  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.35 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1054  Capsule synthesis protein, CapA  31.9 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1080  hypothetical protein  30.2 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5041  hypothetical protein  28.66 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5412  hypothetical protein  28.53 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  28.71 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  27.13 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.35 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.32 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.43 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  47.13 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  32.8 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  28.86 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.17 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  22.71 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  40.62 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  40.91 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  40.7 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2035  CapA family protein  36.46 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0211653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  56 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  36 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.85 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  23.08 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  22.39 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  38.37 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.66 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  55.81 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  35.87 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  23.36 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  55.81 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  52.17 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.32 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  26.27 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  34.35 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  24.79 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6386  Capsule synthesis protein, CapA  58.14 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  37.21 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  25.48 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  61.54 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.23 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  42.47 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  39.02 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  67.57 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  25 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  46.3 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  57.14 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  59.46 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  36.08 
 
 		 369 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  48.08 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  42.86 
 
 		 314 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  25.74 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.28 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  29.57 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  30.77 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  54.76 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  27.34 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3652  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  58.97 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103704  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  29.67 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  25.58 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  29.93 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  36.59 
 
 		 1584 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  52.17 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.8 
 
 		 343 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.02 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  24.26 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  30.77 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  32.53 
 
 		 329 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  56.76 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  24.74 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  41.25 
 
 		 370 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  23.75 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  35.71 
 
 		 1020 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  52.63 
 
 		 710 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  52.38 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  37.97 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  27.59 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.86 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.36 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  38.1 
 
 		 712 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  41.51 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.61 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  56.76 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  25.74 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  30.43 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.64 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.45 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>