122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2279 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2279  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  902    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  52.33 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  37.36 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3228  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.27 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.992169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2656  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.09 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0220  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.52 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1054  Capsule synthesis protein, CapA  31.54 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1080  hypothetical protein  29.36 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5041  hypothetical protein  27.21 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5412  hypothetical protein  26.89 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  29.18 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2035  CapA family protein  46.32 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0211653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  30.04 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  40.54 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  41.24 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  29.04 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  30.66 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  38.61 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  40.57 
 
 		 536 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.69 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  50.67 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  25.46 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.83 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  37 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  42.35 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  39.74 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  38.24 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.34 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  35.9 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  33.03 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.33 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  30.38 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  34.65 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  42.11 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  34.51 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.7 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  29.71 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  24.91 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  40.22 
 
 		 1584 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  36.11 
 
 		 1020 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  28.78 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  27.94 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.31 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  26.42 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  39.8 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  39.71 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  31.87 
 
 		 367 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  37.97 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.33 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.84 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  31.91 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  33.04 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  30.39 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6386  Capsule synthesis protein, CapA  34 
 
 		 845 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.86 
 
 		 331 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  35.09 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.63 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.73 
 
 		 405 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  34.74 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3652  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.95 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103704  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  33.02 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  27.27 
 
 		 851 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  27.27 
 
 		 1299 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  30.08 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  50 
 
 		 337 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  33.98 
 
 		 368 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  33.66 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  26.32 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  34.04 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  40.48 
 
 		 364 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  35.42 
 
 		 392 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  25.69 
 
 		 329 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.57 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  36.08 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  27.71 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  44.68 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.5 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  33 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.57 
 
 		 360 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  32.31 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  51.22 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.94 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.62 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  38.1 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  28.46 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  36.78 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  29.22 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.32 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  36 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>