97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2827 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  87.34 
 
 
536 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  776    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  87.84 
 
 
536 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  87.34 
 
 
536 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  86.91 
 
 
462 aa  608  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  43.42 
 
 
534 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  43.42 
 
 
534 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  43.42 
 
 
534 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  43.18 
 
 
539 aa  322  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  43.18 
 
 
539 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  43.18 
 
 
539 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  42.93 
 
 
507 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  89.63 
 
 
272 aa  318  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  42.08 
 
 
545 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  40.55 
 
 
534 aa  309  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  41.94 
 
 
531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  41.94 
 
 
531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  41.46 
 
 
417 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  44.89 
 
 
400 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  31.89 
 
 
544 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  31.89 
 
 
544 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  32.77 
 
 
541 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  29.71 
 
 
537 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  33.33 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  30.1 
 
 
560 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  30.68 
 
 
560 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  30.1 
 
 
560 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  30.68 
 
 
560 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  30.1 
 
 
560 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  30.68 
 
 
560 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  26.93 
 
 
552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  26.93 
 
 
552 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  25.6 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  25.6 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  25.6 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  25.6 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  25.6 
 
 
552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  24.6 
 
 
552 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  24.33 
 
 
552 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  24.33 
 
 
552 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  24.33 
 
 
552 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  24.33 
 
 
552 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  24.33 
 
 
552 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  24.33 
 
 
552 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  24.33 
 
 
552 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  24.33 
 
 
552 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  24.06 
 
 
552 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  24.06 
 
 
552 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
560 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  45 
 
 
93 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  25.86 
 
 
538 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  26.22 
 
 
572 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  26.22 
 
 
572 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  24.9 
 
 
537 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  24.9 
 
 
537 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  51.22 
 
 
71 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.58 
 
 
547 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
548 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  28.97 
 
 
449 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.97 
 
 
566 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 
604 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  25.58 
 
 
604 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  26.15 
 
 
604 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  26.15 
 
 
604 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  26.15 
 
 
604 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  26.27 
 
 
604 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  30.16 
 
 
604 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  30.16 
 
 
604 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  30 
 
 
532 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  30 
 
 
532 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  30.67 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  30.67 
 
 
563 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2237  hypothetical protein  24.54 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  28.89 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  28.72 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  24.87 
 
 
559 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
594 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>