40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0582 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0582  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  28.49 
 
 		 906 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  28.49 
 
 		 906 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  28.04 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  28.08 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  27.92 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  24.84 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.58 
 
 		 714 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.21 
 
 		 721 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.14 
 
 		 695 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.17 
 
 		 908 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.76 
 
 		 727 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  19.67 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.01 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  30.46 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  27.14 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.62 
 
 		 717 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  28.38 
 
 		 716 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.62 
 
 		 716 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.95 
 
 		 1011 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  26.63 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.45 
 
 		 908 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0372  hypothetical protein  28.17 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  23.94 
 
 		 737 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.52 
 
 		 736 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.74 
 
 		 1018 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  37.5 
 
 		 721 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  25.2 
 
 		 725 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.01 
 
 		 1018 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  25.65 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  25.56 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.75 
 
 		 1040 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  26.17 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0043  hypothetical protein  27.46 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160534  normal  0.369707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5230  peptidase C39 bacteriocin processing  24.82 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19192  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  24.15 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  24.15 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  21.65 
 
 		 363 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  24.83 
 
 		 735 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0126  hypothetical protein  23.86 
 
 		 258 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>