More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0401 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0401  transcription elongation factor, putative  100 
 
 		 166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1137  GreA/GreB family elongation factor  54.88 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4508  GreA/GreB family elongation factor  51.23 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4873  GreA/GreB family elongation factor  48.19 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.772503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0676  GreA/GreB family elongation factor  49.38 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0708  GreA/GreB family elongation factor  50.31 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0707  GreA/GreB family elongation factor  49.38 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.975764  normal  0.0706669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2011  putative transcription elongation factor  49.38 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0721  GreA/GreB family elongation factor  49.38 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.44423  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2845  GreA/GreB family elongation factor  48.15 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4263  transcription elongation factor GreA/GreB  45.78 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2366  GreA/GreB family elongation factor  50.68 
 
 		 153 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.805703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4601  transcription elongation factor GreB  46.34 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4333  GreA/GreB family elongation factor  50 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4186  GreA/GreB family elongation factor  49.38 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3876  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  48.77 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131848  normal  0.0366089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3833  GreA/GreB family elongation factor  48 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  44.81 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0865  transcription elongation factor GreB  40.22 
 
 		 186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0950  transcription elongation factor GreB  40.22 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380314  hitchhiker  0.0000173092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4332  transcription elongation factor GreB  39.01 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2930  transcription elongation factor regulatory protein  44.14 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5139  transcription elongation factor regulatory protein  43.71 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276669  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2023  transcription elongation factor GreB  37.78 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5114  transcription elongation factor regulatory protein  42.17 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2707  GreA/GreB family elongation factor  46.62 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1741  transcription elongation factor regulatory protein  42.86 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1580  transcription elongation factor regulatory protein  43.71 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0460715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1126  transcription elongation factor GreB  34.64 
 
 		 185 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.19101e-20  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  40.54 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0165  transcription elongation factor GreB  37.78 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0909  transcription elongation factor GreB  39.78 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  37.5 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3586  transcription elongation factor GreB  38.5 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687664  hitchhiker  0.00676969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3081  transcription elongation factor GreB  38.67 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0292072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2152  transcription elongation factor GreB  36.46 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000119957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0395  transcription elongation factor GreB  44.23 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0662581  normal  0.0531871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2273  transcription elongation factor GreB  36.26 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1950  transcription elongation factor GreB  36.26 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697488  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4357  transcription elongation factor regulatory protein  42.42 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2723  transcription elongation factor  37.02 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0558  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  44.59 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3202  transcription elongation factor regulatory protein  40.61 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0732  transcription elongation factor GreB  36.81 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0859  transcription elongation factor GreB  35.36 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0673  transcription elongation factor GreB  36.56 
 
 		 190 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0253655  normal  0.983843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1591  transcription elongation factor GreB  36.87 
 
 		 187 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000320355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0556  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  43.92 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1332  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.294175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2146  transcription elongation factor regulatory protein  42.26 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2470  transcription elongation factor GreB  34.81 
 
 		 188 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0253654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1165  transcription elongation factor regulatory protein  42.57 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0874  transcription elongation factor GreB  38.89 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0745968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0862  transcription elongation factor GreB  38.89 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000987565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2668  transcription elongation factor GreB  38.41 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049462  normal  0.0488826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2390  transcription elongation factor regulatory protein  40.85 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0124543  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01570  transcription elongation factor, putative  37.87 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2091  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3044  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00484653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2944  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3010  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0820  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1959  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2653  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0303907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4110  transcription elongation factor GreB  38.33 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000102094  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1206  GreA/GreB family elongation factor  42.57 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0523  transcription elongation factor GreB  38.92 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000760648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0962  transcription elongation factor GreB  38.92 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00012209  normal  0.571045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1002  transcription elongation factor GreB  38.92 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0052225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0323  transcription elongation factor GreB  41.33 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.276985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1441  GreA/GreB family elongation factor  36.42 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0808  transcription elongation factor GreB  37.99 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3150  GreA/GreB family elongation factor  35.56 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  34.62 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2863  transcription elongation factor GreB  39.35 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3408  GreA/GreB family elongation factor  41.22 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2677  GreA/GreB family elongation factor  39.07 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1201  transcription elongation factor GreB  34.87 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0727535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2396  transcription elongation factor GreB  36.96 
 
 		 187 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4579  GreA/GreB family elongation factor  36.42 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.063222  normal  0.427466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1105  GreA/GreB family elongation factor  35.59 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.340307  normal  0.981817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1733  transcription elongation factor GreB  38.82 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0896689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3777  transcription elongation factor GreB  35.9 
 
 		 196 aa  84  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1075  transcription elongation factor GreB  33.75 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0718  GreA/GreB family elongation factor  38.81 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.188728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  38.81 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3636  transcription elongation factor GreB  37.01 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  34.39 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0151  transcription elongation factor GreB  36.22 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  39.42 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  42.45 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>