181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1940 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1940  phosphoesterase  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.639858  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2297  phosphoesterase family protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  52.14 
 
 
523 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  52.14 
 
 
538 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  55.84 
 
 
456 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  53.25 
 
 
438 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  58.57 
 
 
525 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  58.57 
 
 
538 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  57.14 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  49.44 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  48.31 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  54.79 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  51.95 
 
 
506 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  53.42 
 
 
528 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  52.05 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  52.05 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  53.42 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  53.42 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  53.42 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  52.05 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  46.07 
 
 
715 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  46.15 
 
 
532 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  50.68 
 
 
514 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  43.82 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  42.71 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  43.82 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  53.23 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  54.84 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  47.19 
 
 
554 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  52.38 
 
 
567 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  46.07 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  44.94 
 
 
560 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  50.82 
 
 
709 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  51.61 
 
 
586 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  51.61 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  51.61 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  51.61 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  51.61 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  50.79 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
577 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
577 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
553 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
553 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
553 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  43.82 
 
 
553 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  43.82 
 
 
577 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  50 
 
 
560 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  49.21 
 
 
553 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  37.5 
 
 
522 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  45.57 
 
 
546 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  38.96 
 
 
369 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  46.43 
 
 
434 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  33.71 
 
 
511 aa  62.4  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
711 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.54 
 
 
719 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.58 
 
 
719 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1068  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.66 
 
 
734 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233331  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  37.66 
 
 
534 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  38.64 
 
 
714 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4198  phospholipase C  41.43 
 
 
715 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0078  phospholipase C  38.96 
 
 
749 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  44.62 
 
 
687 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  39.06 
 
 
691 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1377  phospholipase C  41.89 
 
 
735 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.46368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  39.68 
 
 
626 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  38.55 
 
 
709 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  40 
 
 
749 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  40 
 
 
731 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1010  phosphoesterase  31.25 
 
 
532 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00457541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  35 
 
 
655 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1035  phosphoesterase  30.34 
 
 
451 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  28 
 
 
495 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  28 
 
 
495 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  28 
 
 
495 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  28 
 
 
495 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  28 
 
 
495 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  28 
 
 
506 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  28 
 
 
506 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.9 
 
 
708 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  35.06 
 
 
745 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  29.37 
 
 
713 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.02 
 
 
686 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  38.2 
 
 
415 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  38.2 
 
 
415 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.73 
 
 
700 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  31.58 
 
 
704 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.51 
 
 
752 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
704 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  33.33 
 
 
704 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  38.2 
 
 
415 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>