254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0005 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0004  hypothetical protein  100 
 
 
1168 aa  2396    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0335  hypothetical protein  45.87 
 
 
1231 aa  1002    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.219627  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1478  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  51.97 
 
 
1171 aa  1189    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1082  hypothetical protein  38.55 
 
 
960 aa  676    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0297  hypothetical protein  37.25 
 
 
1130 aa  807    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1583  hypothetical protein  67.65 
 
 
1170 aa  1597    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1150  hypothetical protein  43.94 
 
 
1192 aa  880    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0566  hypothetical protein  43.36 
 
 
1186 aa  830    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0778  hypothetical protein  37.55 
 
 
1132 aa  818    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0700  hypothetical protein  51.89 
 
 
1168 aa  1188    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000850641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0005  hypothetical protein  100 
 
 
1168 aa  2396    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0881557  hitchhiker  0.000952337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1060  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.54 
 
 
1237 aa  983    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2584  hypothetical protein  64.4 
 
 
1164 aa  1481    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1063  hypothetical protein  60.14 
 
 
1165 aa  1360    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.553443  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0661  FAD-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
1243 aa  471  1.0000000000000001e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1267  hypothetical protein  38.1 
 
 
202 aa  153  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.678758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  29.57 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.52 
 
 
479 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  27.29 
 
 
483 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  26.13 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  29.08 
 
 
472 aa  72  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  29.62 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  26.74 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2151  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.73 
 
 
281 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  28.61 
 
 
482 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.89 
 
 
476 aa  71.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  25.3 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.87 
 
 
944 aa  69.7  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.1 
 
 
280 aa  69.7  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  31.23 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.25 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1118  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  32.69 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  24.48 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  28.03 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  27.64 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  26.48 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  30.18 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.51 
 
 
944 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1283  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  33.97 
 
 
286 aa  67.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  24.38 
 
 
483 aa  67.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.32 
 
 
942 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.01 
 
 
464 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0316  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  31.33 
 
 
279 aa  66.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  30.13 
 
 
747 aa  65.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0085  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.35 
 
 
276 aa  65.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00250473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  25.65 
 
 
493 aa  65.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.8 
 
 
947 aa  65.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  26.69 
 
 
468 aa  65.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  25.97 
 
 
493 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  26.97 
 
 
468 aa  65.1  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.45 
 
 
283 aa  64.7  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000255012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_35  GltD-like oxidoreductase, FAD/NAD(P)-binding, PyrK  29.11 
 
 
282 aa  64.7  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  27.38 
 
 
448 aa  64.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  30.03 
 
 
463 aa  64.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
469 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0550  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  30.22 
 
 
279 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0408  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  28.14 
 
 
278 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000248639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1251  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  28.95 
 
 
282 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  28.46 
 
 
944 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  24.57 
 
 
480 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  27.68 
 
 
465 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0282  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  25.15 
 
 
288 aa  62.4  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3502  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.44 
 
 
282 aa  62.4  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.190562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
471 aa  62.4  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  24.85 
 
 
761 aa  62.4  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3636  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  29.8 
 
 
282 aa  62  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0117142  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  24.81 
 
 
464 aa  62  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  24.67 
 
 
462 aa  62  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1608  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.01 
 
 
287 aa  62  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  28.43 
 
 
445 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  28.85 
 
 
445 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  27.49 
 
 
455 aa  61.6  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2861  glutamate synthase subunit beta  26.39 
 
 
455 aa  61.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  29 
 
 
445 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1280  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.07 
 
 
262 aa  61.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  29 
 
 
445 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  26.97 
 
 
493 aa  61.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0034  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.85 
 
 
282 aa  61.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  23.87 
 
 
465 aa  60.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2829  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  29.73 
 
 
279 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0857645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.33 
 
 
469 aa  60.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0037  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.85 
 
 
282 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  25.14 
 
 
479 aa  59.3  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  27.1 
 
 
447 aa  59.3  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  25.51 
 
 
465 aa  58.9  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  25.9 
 
 
480 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1111  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  31.65 
 
 
284 aa  58.5  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  26.84 
 
 
477 aa  58.5  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1692  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.56 
 
 
281 aa  58.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0374  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.14 
 
 
258 aa  58.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  29.64 
 
 
445 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  25.51 
 
 
491 aa  58.2  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  24.25 
 
 
994 aa  58.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  28.02 
 
 
459 aa  58.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  26.53 
 
 
491 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.12 
 
 
467 aa  57.4  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  24.07 
 
 
494 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  25.31 
 
 
467 aa  57.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  24.92 
 
 
493 aa  57.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  26.95 
 
 
488 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>