More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1351 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1351  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0819585  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3228  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  44.11 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  44.11 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  45.86 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1064  AraC-like transcriptional regulator  39.93 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  44.74 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  43.02 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  40.3 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 329 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  43.98 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3214  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  43.1 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.43 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  40.14 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  39.92 
 
 		 336 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.93 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  39.85 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  42.91 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  39.1 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 330 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 315 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2948  transcriptional regulator, AraC family  38.4 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0708341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  40.15 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  38.06 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  36.57 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  36.93 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  34.88 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  36.93 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 354 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 327 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  36.36 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  39.51 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  38.83 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0807  transcriptional regulator, AraC family  42.56 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  38.93 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0407  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 373 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>