33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0188 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 652 aa  1301    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.489621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 		 651 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  21.84 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  22.71 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 		 359 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  22.55 
 
 		 320 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  20.94 
 
 		 595 aa  51.2  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  26.6 
 
 		 310 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 		 339 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 		 611 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  25.12 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27.45 
 
 		 573 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 		 339 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 327 aa  47.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 647 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 334 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.27 
 
 		 599 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 318 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  29.35 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 701 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  22.72 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  32.97 
 
 		 304 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0268  hypothetical protein  36.17 
 
 		 316 aa  44.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.153737  normal  0.086927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 344 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 312 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 315 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 517 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>